称谓
细菌 细菌域 Bacteria
分类
• 细菌域（Bacteria）
• 假单胞菌门（Pseudomonadota，变形菌门，Proteobacteria）
• 生丝微菌目（Hyphomicrobiales）
• 硝化杆菌科（Nitrobacteraceae，硝化菌科）
• [[0. 硝化杆菌属（Nitrobacter）]]
• [[Nitrobacter alkalicus]]
• [[Nitrobacter hamburgensis]]
• [[Nitrobacter vulgaris]]
• [[Nitrobacter winogradskyi]]
• 酸硫杆菌纲（Acidithiobacillia）
• Acidithiobacillaceae科
• [[0. 酸硫杆菌属（Acidithiobacillus）]]
• [[嗜酸氧化亚铁硫杆菌（Acidithiobacillus ferrooxidans）]]
• [[Acidithiobacillus thiooxidans]]
• [[0. α-变形菌纲（Alphaproteobacteria）]]
• 鞘脂单胞菌目（Sphingomonadales）
• 赤杆菌科（Erythrobacteraceae）
• [[赤细菌属（Erythrobacter）]]
• Hyphomicrobiales目
• Beijerinckiaceae科
• [[拜叶林克氏菌属（Berjerinckia）]]
• Nitrobacteraceae科
• [[0. 红假单胞菌属（Rhodopseudomonas）]]
• [[Rhodopseudomonas palustris]]
• Rhizobiaceae科
• [[根瘤菌属（Rhizobium）]]
• [[农杆菌属（Agrobacterium）]]
• Rhodobacterales目
• Rhodobacteraceae科
• [[0. 红细菌属（Rhodobacter，红杆菌属）]]
• [[Rhodobacter capsulatus]]
• [[Rhodobacter sphaeroides]]
• Rhodospirillales目
• Azospirillaceae科
• [[0. 固氮螺菌属（Azospirillum）]]
• [[0. 红螺菌属（Rhodosperillumn）]]
• [[Rhodospirillum rubrum]]
• [[0. β -变形菌纲（Betaproteobacteria）]]
• Burkholderiales目
• Alcaligenaceae科
• [[产碱菌属（Alcaligenes）]]
• [[纤发菌属（Leptothrix）]]
• Nitrosomonadaceae目
• [[0. 亚硝化螺菌属（Nitrosospira）]]
• [[Nitrosospira briensis]]
• [[Nitrosospira multiformis]]
• Nitrosomonadales目
• Nitrosomonadaceae科
• [[0. 亚硝化叶菌属（Nitrosolobus）]]
• Thiobacillacaeae科
• [[0. 硫杆菌属（Thiobacillus）]]
• [[Thiobacillus sp. W5]]
• Spirillales目
• Nitrosomonadaceae科
• [[0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas）]]
• [[Nitrosomonas sp. AL212]]
• [[Nitrosomonas sp. Is79]]
• 谱系1
• [[欧亚亚硝化单胞菌（Nitrosomonas europaea）]]
• [[Nitrosomonas eutropha]]
• [[Nitrosomonas halophila]]
• [[Nitrosomonas mobilis]]
• 谱系2
• [[Nitrosomonas communis]]
• [[Nitrosomonas sp. I]]
• [[Nitrosomonas sp. II]]
• 谱系3
• [[Nitrosomonas nitrosa]]
• 谱系4
• [[Nitrosomonas oligotropha]]
• [[Nitrosomonas ureae]]
• 谱系5、6
• [[Nitrosomonas cryotolerans]]
• [[Nitrosomonas estuarii]]
• [[Nitrosomonas marina]]
• [[Nitrosomonas sp. III]]
• [[0. γ-变形菌纲（Gammaproteobacteria）]]
• [[着色菌目（Chromatiales，紫硫细菌）]]
• 肠杆菌目（Enterobacterales）
• 肠杆菌科（Enterobacteriaceae）
• 埃希氏菌属（Escherichia）
• [[大肠杆菌（Escherichia coli，大肠埃希菌）]]
• [[0. 克雷伯氏菌属（Klebsiella）]]
• [[0. 沙门氏菌属（Salmonella）]]
• Alteromonadales目
• Shewanellaceae科
• [[0. 希瓦氏菌属（Shewanella）]]
• [[希瓦氏菌（Shewanella sp.）]]
• [[Shewanella oneidensis]]
• Chromatiales目
• [[0. 着色菌科（Chromatiaceae）]]
• [[亚硝化球菌属（Nitrosococcus）]]
• [[着色菌属（Chromatium）]]
• [[0. 外硫红螺菌科（Ectothiorhodospiraceae）]]
• [[0. 硝化球菌属（Nitrococcus）]]
• [[Nitrococcus mobilis]]
• Pseudomonadales目
• Pseudomonadaceae科
• [[0. 固氮菌属（Azotobacter）]]
• [[0. 假单胞菌属（Pseudomonas）]]
• [[0. 绿脓杆菌（Pseudomonas aeruginosa，铜绿假单胞菌）]]
• Thiotrichales目
• [[0. 硫丝菌科（Thiotrichaceae）]]
• [[贝氏硫菌属（Beggiatoa）]]
• [[发硫菌属（Thiothrix）]]
• [[硫螺菌属(Thiospira)]]
• [[0. 硫珠菌属（Thiomargarita）]]
• [[Thiomargarita namibiensis]]
• Vibrionales目
• Vibrionaceae科
• Vibrio属
• [[霍乱弧菌（Vibrio cholerae）]]
• 陆生细菌分支（Terrabacteria，陆细菌）
• 革兰氏阳性菌
• [[0. 放线菌门（Actinomycetota，BV5）]]
• [[0. 芽孢杆菌门（Bacillota，厚壁菌门，Firmicutes）]]
• 杆菌
• 芽孢杆菌纲（Bacilli）
• 核衣细菌目（Caryophanales）
• 葡萄球菌科（Staphylococcaceae）
• [[0. 葡萄球菌属（Staphylococcus）]]
• [[金黄色葡萄球菌（Staphyloccus aureus）]]
• 芽孢杆菌科（Bacillaceae）
• [[0. 芽孢杆菌属（Bacillus）]]
• [[枯草芽孢杆菌（Bacillus subtilis）]]
• Caryophanaceae科
• Sporosarcina属
• [[巴氏生孢八叠球菌（Sporosarcina pasteurii）]]
• Bacillales目
• Paenibacillaceae科
• Paenibacillus属
• [[多粘芽胞杆菌（Paenibacillus polymyxa，多粘类芽胞杆菌，Bacillus polymyxa）]]
• Lactobacillales目
• Lactobacillaceae科
• [[乳酸菌属（Lactobacillus，乳杆菌属，乳酸杆菌属）]]
• 梭菌
• 梭菌纲（Clostridia）
• 真细菌目 Eubacteriales
• 互营单胞菌科 Syntrophomonadaceae
• [[嗜热互营杆菌属（Thermosyntropha）]]
• Clostridiaceae科
• Clostridium属
• [[巴氏梭菌（Clostridium pasteurianum）]]
• 梭菌目（Clostridiales）
• Desulfitobacteriaceae科
• [[Desulfosporosinus属]]
• Peptococcaceae科
• [[Desulfotomaculum属]]
• Eubacteriales目
• Heliobacteriaceae科
• [[太阳杆菌（Heliobacteria，日光杆菌）]]
• [[0. Negativicutes纲]]
• Selenomonadales目
• Veillonellaceae科
• [[Desulfosporomusa属]]
• 滑行菌（BV1）
• 初细菌
• [[0. 绿弯菌门（Chloroflexota）]]
• 绿弯菌纲（Chloroflexia）
• 绿弯菌目（Chloroflexales）
• 绿弯菌科（Chloroflexaceae）
• 其他
• [[0. 蓝菌门（Cyanobacteria，蓝细菌）]]
• 蓝菌纲（Cyanobacteria）
• [[0. 颤藻目（Oscillatoriales）]]
• [[0. 颤藻科（Oscillatoriaceae）]]
• [[0. 颤藻属（Oscillatoria）]]
• [[巨颤藻（Oscillatoria princeps）]]
• 微鞘藻科（Microcoleaceae）
• [[0. 节旋藻（Arthrospira，螺旋藻）]]
• [[钝顶节旋藻（Arthrospira platensis）]]
• [[极大节旋藻（Arthrospira maxima）]]
• 念珠藻目（Nostocales）
• 念珠藻科（Nostocaceae）
• [[念珠藻属（Nostoc）]]
• 束丝藻科（Aphanizomenonaceae）
• [[0. 鱼腥藻属（Anabaena）]]
• [[满江红鱼腥藻（Anabaena azollae）]]
• 色球藻目（Chroococcales）
• 微囊藻科（Microcystaceae）
• [[0. 微囊菌属（Microcystis，微囊藻属）]]
• [[铜绿微囊菌（Microcystis aeruginosa，铜绿微囊藻）]]
• [[0. 绿菌门（Chlorobi）]]
• 绿菌纲（Chlorobia）
• 绿菌科（Chlorobiaceae）
• [[0. 绿菌属（Chlorobium）]]
• [[0. 弯曲杆菌门（Campylobacterota）]]
• Campylobacteria纲
• Campylobacterales目
• Helicobacteraceae科
• [[0. 卵硫菌属（Thiovulum）]]
• [[Thiovulum majus]]
• [[0. 硝化刺菌门（Nitrospinota）]]
• [[0. 硝化脊菌属（Nitrospina，硝化刺菌属）]]
• [[Nitrospina gracilis]]
• [[Nitrospina watsonii]]
• [[Nitrospira marina]]
• [[0. 硝化螺旋菌门（Nitrospirota）]]
• Nitrospira纲
• Nitrospirales目
• Nitrospiraceae科
• [[0. 硝化螺菌属（Nitrospira）]]
• [[硝螺旋菌莫斯科种（Nitrospira moscoviensis）]]
• [[硝螺旋菌意外种（Nitrospira inopinata）]]
• [[0. 钩端螺旋菌属（Leptospirillum）]]
• [[Leptospirillum ferriphilum]]
• [[0. 蛭弧菌门（Bdellovibrionota）]]
• [[蛭弧菌]]
• [[0. 水栖菌门（产水菌门，Aquificota）]]
• Deferribacterota门
• Deferribacteres纲
• Deferribacterales目
• Deferribacteraceae科
• [[脱铁杆菌属（Deferribacter）]]
• FCB组
• [[0. 拟杆菌门（Bacteroidota）]]
• Flavobacteriia纲
• Flavobacteriales目
• Flavobacteriaceae科
• [[黄杆菌属（Flavobacterium）]]
• Negibacteria分支
• [[0. 奇异球菌门（异常球菌门，Deinococcota）]]