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Nitrosomonas sp. Is79
Nitrosomonas sp. Is79隶属于 0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） ，细胞短杆状至椭圆形， 革兰氏阴性菌（G-菌） 。细胞膜内侧可见层叠的内膜系统，是氨单加氧酶（AMO）与羟胺氧化还原酶（HAO）的主要载体。 Is79为 0. 化能自养型微生物 ，专性好氧，以 0. 氨氮 氧化为唯一能量来源。本菌株分离自寡营养环境，对低浓度氨…
杆菌界（Bacillati）
- 0. 传统分类：革兰氏阳性菌
革兰氏阳性菌（G+菌）
革兰氏阳性菌（Gram-positive bacteria, G+菌） 被染色成蓝紫色 20 80nm - 肽聚糖层:90% - 磷壁酸:10% - 磷酸分子吸引更多的^ 2+ $、^ 2+ $ ，或促进一些酶的活性 - 调节细胞内自溶素的活力，防止细胞自溶 - 增强细菌对宿主细胞的粘连 - 五肽交联桥（pentapeptide cross-br…
衣原体属（Chlamydia）
是一类严格细胞内寄生的真细菌类微生物
氨氮
氨氮（ammonia nitrogen）是水体中以游离氨（$\text NH 3$）和铵离子（$\text NH 4^+$）形式存在的含氮化合物的总称，以氮计量。在水族养殖中，氨氮是最重要的水质指标之一，其浓度直接关系到鱼类的生存。氨氮的来源主要是鱼类代谢排泄物、残饵分解以及有机物（蛋白质、 0. 氨基酸 ）的微生物降解脱氨过程。 $\text NH 3$ …
化能自养型微生物
本节概述参与硫元素代谢的化能自养型微生物。这类微生物以无机还原态硫化物为电子供体，通过氧化反应获取能量，以CO₂为碳源合成有机物。它们是硫循环中硫氧化过程的关键驱动者。 化能自养型硫代谢微生物主要包括以下类群： - 化能自养型硫细菌（无色硫细菌，CSB） ：如硫杆菌属（ Thiobacillus ）、贝日阿托菌属（ Beggiatoa ），是鱼缸中最重要的硫…
肠杆菌科（Enterobacteriaceae）
- 0. 埃希氏菌属（Escherichia） - 0. 克雷伯氏菌属（Klebsiella） - 0. 沙门氏菌属（Salmonella）
头孢美唑（Cefmetazole）
头孢美唑是 0. 头霉素类（Cephamycins） 的代表品种之一。与 头孢西丁（Cefoxitin） 同样具有7α-甲氧基结构，对 0. β-内酰胺酶（β-lactamase） 稳定。其侧链含有NMTT基团（N-甲基硫代四唑），可引起低凝血酶原血症和双硫仑样反应，使用时需特别注意。主要在日本和中国临床应用。 通过与细菌 青霉素结合蛋白（PBP） 结合，阻…
革兰氏阴性菌（G-菌）
革兰氏阴性菌 Gram-negative bacteria G-菌 被染成红色 15 20nm - 外膜： - 最外层脂多糖，约等于内毒素，会引起身体的强烈免疫反应 - 磷脂、外膜蛋白 - 具有选择透过性，存在一些孔蛋白控制物质进出。 - 2 3nm厚：1 2层肽聚糖层，占细胞壁总质量的5% 10% - 周质空间 细胞周质 Periplasm，周质空间 ：包…
头孢替坦（Cefotetan）
头孢替坦是 0. 头霉素类（Cephamycins） 中半衰期最长的品种（约3.5h），可每12小时给药一次（BID），给药便利性在同类中最佳。含NMTT侧链，有低凝血酶原血症和双硫仑样反应风险。在美国广泛用于妇科/结直肠手术预防及盆腔炎性疾病治疗，但在部分地区正逐渐被更新药物替代。 与 青霉素结合蛋白（PBP） 结合，阻断 0. 肽聚糖（peptidogl…
Nitrosomonas halophila
Nitrosomonas halophila 属 0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） 谱系1，细胞呈短杆状至椭圆形， 革兰氏阴性菌（G-菌） 。胞内可见层叠的内膜系统，为氨单加氧酶（AMO）和羟胺氧化还原酶（HAO）的功能载体。 本种为专性好氧的 0. 化能自养型微生物 ，以 0. 氨氮 为唯一能源。 N. halophila 的突出特征是嗜盐…
假单胞菌界（Pseudomonadati）
假单胞菌界是一个包含约三分之一原核生物物种的界，其中多数为 革兰氏阴性菌（G-菌） 及其近缘类群。它与细菌域中一个更大的界 —— 0. 杆菌界（Bacillati） 亲缘关系最近，杆菌界的物种多为 革兰氏阳性菌（G+菌） 。 其同义名 “Hydrobacteria”（hydro 意为 “水”），指的是据推测该类群物种共同祖先所处的湿润环境。相比之下，杆菌界的…
Nitrosospira briensis
Nitrosospira briensis 为 0. 亚硝化螺菌属（Nitrosospira） 的模式种，细胞呈螺旋形，旋转1.5–3.5圈，宽约0.3–0.4 μm。 革兰氏阴性菌（G-菌） ，具极生鞭毛，在液体培养基中活跃运动。胞内内膜系统较 0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） 成员薄，但仍是氨单加氧酶（AMO）的主要载体。 本种为专性好氧…
志贺菌属（Shigella）
志贺菌属（Shigella）隶属于 0. 肠杆菌科（Enterobacteriaceae） ，为一类不运动、无荚膜的 革兰氏阴性菌（G-菌） 短杆菌。形态上与 0. 埃希氏菌属（Escherichia） 极为相似，实际上分子系统学研究表明二者在遗传距离上几乎不可分，志贺菌可视为大肠杆菌的致病性生态型。 本属细菌为兼性厌氧菌，不发酵乳糖（与典型 大肠杆菌（Es…
Nitrosomonas cryotolerans
Nitrosomonas cryotolerans 隶属于 0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） 谱系5/6。细胞短杆状至椭圆形， 革兰氏阴性菌（G-菌） ，胞内含层叠内膜系统。外膜含 脂多糖（LPS） 。 本种为专性好氧的 0. 化能自养型微生物 。种名"cryotolerans"意为"耐低温"，反映其突出的冷适应能力——可在0–5°C下维持 …
Deferribacter属
脱铁杆菌属（Deferribacter）为脱铁杆菌门（Deferribacterota）脱铁杆菌纲脱铁杆菌目脱铁杆菌科的模式属。属名源自拉丁语"de-"（去除）与"ferri-"（铁），意指其以还原 Fe III 为核心代谢特征。本属为嗜热厌氧菌，主要分布于深海热泉环境。 菌体杆状至微弯，大小约0.5 × 2.0–4.0 μm，具单根极生鞭毛，运动性好。属 …
总目录
tldr 总目录 - 0. 养鱼 - 0. 第16章：鱼类身体结构 - 0. 细胞结构 - 0. 生物化学 - 0. 药理学 - 0. 物种分类 - 0. 化学 - 0. 数学 seealso 优秀笔记展示 example 养鱼和生态 - 0. 经典
Nitrosomonas estuarii
Nitrosomonas estuarii 隶属于 0. 亚硝化单胞菌属（Nitrosomonas） 谱系5/6。细胞呈短杆状至椭圆形， 革兰氏阴性菌（G-菌） 。胞内含层叠内膜系统。可见极生或侧生鞭毛。 本种为专性好氧的 0. 化能自养型微生物 ，以 0. 氨氮 氧化为唯一能源。种名"estuarii"指示其典型生境——河口区域。 N. estuarii …
鱼类衣原体（Chlamydia piscicola）
鱼类衣原体（Chlamydia piscicola）为 0. 衣原体属（Chlamydia） 中首个以鱼类为宿主的种，属专性胞内寄生菌。本种是北极红点鲑（Arctic charr）等冷水性鱼类上皮囊肿病（epitheliocystis）的重要病原，在水产养殖中具有显著的经济意义。 具衣原体目典型的双相发育周期，感染性原体（EB）呈球形，在鱼鳃上皮细胞内形成特…
乳球菌属（Lactococcus）
乳球菌属（ Lactococcus ）是 0. 细菌（Bacteria，细菌域） 界厚壁菌门乳杆菌目链球菌科的革兰氏阳性球菌，细胞呈球形至卵圆形（直径0.5-1.5 μm），通常成对或短链排列。该属为兼性厌氧菌，以同型乳酸发酵为主要代谢方式——将葡萄糖几乎定量转化为L-乳酸。模式种乳酸乳球菌（ L. lactis ）是乳制品工业最重要的发酵剂菌种，亦是分子生…
S-腺苷甲硫氨酸（SAM）
S-腺苷甲硫氨酸 S-腺苷蛋氨酸 S-adenosylmethionine SAM smiles C S+ CC C@@H C =O O- N C C@@H 1 C@H C@H C@@H O1 N2C=NC3=C N=CN=C32 N O O $结构式：$ - tikz \usepackage chemfig \begin document
沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis）
沙眼衣原体（Chlamydia trachomatis）为 0. 衣原体属（Chlamydia） 的模式种，属专性胞内寄生菌。本种是人类沙眼（trachoma）及泌尿生殖道感染的病原体，也是全球最常见的细菌性性传播感染病因。 具衣原体目特有的双相发育周期。感染性原体（EB）呈致密球形，直径约0.3 μm；网状体（RB）较大，直径约1.0 μm，在宿主细胞包涵…
头孢米诺（Cefminox）
头孢米诺是 0. 头霉素类（Cephamycins） 中抗厌氧菌活性最强的品种。对 脆弱拟杆菌（Bacteroides fragilis） 的MIC值在同类药物中最低。不含NMTT侧链，无低凝血酶原血症和双硫仑样反应风险，安全性优于 头孢美唑（Cefmetazole） 和 头孢替坦（Cefotetan） 。半衰期较长（约2.3h），给药间隔可适当延长。主要在…
第8章：碳元素循环
0. 碳循环：溶解度泵、碳酸盐泵、生物泵 1. 碳循环：水体中有机物的降解
肺炎衣原体（Chlamydia pneumoniae）
肺炎衣原体（Chlamydia pneumoniae）为 0. 衣原体属（Chlamydia） 的成员，属专性胞内寄生菌。本种主要感染人类呼吸道，为社区获得性肺炎的常见病因之一。与 鱼类衣原体（Chlamydia piscicola） 不同，本种不以水生动物为宿主。 具衣原体目典型的双相发育周期：感染性原体（EB）呈球形，直径约0.2–0.4 μm，代谢不活…
牙龈卟琳单胞菌（Porphyromonas gingivalis，牙龈紫单胞菌）
牙龈紫单胞菌（Porphyromonas gingivalis）隶属于拟杆菌门（Bacteroidota），是一种无运动性、革兰氏阴性、杆状、厌氧的致病菌。在血琼脂培养基上可形成黑色菌落。 该菌存在于口腔中，与牙周病相关，也可见于上消化道、呼吸道和结肠。在细菌性阴道病女性患者中也曾分离出该菌。 慢性牙周病中观察到的胶原蛋白降解，部分源于该菌产生的胶原酶。体外…
腺苷激酶（ADK）
腺嘌呤核苷+ATP AMP：单磷酸腺苷，腺嘌呤核糖核苷酸，腺苷酸 +ADP+ i$ 生物体内只有腺苷激酶，无其他嘌呤核苷激酶
对于AOB的研究：结论和未来展望
从本综述可以明确看出，氨氧化细菌（AOB）拥有多种生理特性，这些特性可以在底物和氧气供应变化的环境下有利于它们的生存。此外，AOB拥有一系列酶学和分子机制，使它们能够在饥饿状态下维持细胞状态，以便在底物或氧气耗尽后，氨氧化作用可以在几分钟内以高速率重新开始。更进一步，在AOB群体内部，对高或低氨或氧浓度条件下的适应性和竞争力存在差异。此外，它们似乎能够通过细…
脱氧核苷酸的合成
脱氧核苷酸的合成是DNA复制的前提。核糖核苷酸在二磷酸水平上经核糖核苷酸还原酶（RNR）催化C2'位还原为脱氧核糖核苷酸。RNR以硫氧还蛋白或谷氧还蛋白为电子供体，NADPH为最终还原力来源。RNR具有精密的别构调控机制：活性位点受底物特异性位点控制底物选择，总活性位点受dATP抑制、ATP激活，确保四种dNTP比例平衡。dUMP经胸苷酸合酶（TS）催化，以…
亚硝化叶菌属（Nitrosolobus）
亚硝化螺菌属隶属于 0. β -变形菌纲（Betaproteobacteria） 螺菌目（Spirillales）亚硝化单胞菌科（Nitrosomonadaceae）。本属成员细胞形态多样：螺旋形、弧形或小叶状（前 0. 亚硝化叶菌属（Nitrosolobus） 成员）。 革兰氏阴性菌（G-菌） ，部分种具鞭毛。胞内含内膜系统，为氨单加氧酶（AMO）分布区域…