概述
不等鞭毛总门（Stramenopiles，又称异鞭毛类 heterokonts）是真核生物SAR超类群中物种多样性极高的一个大类群，涵盖了从单细胞藻类到大型多细胞[[0. 褐藻门（Phaeophyta）]]、以及类真菌的卵菌等形态迥异的生物。其最显著的共衍征（synapomorphy）是具有两条不等长的鞭毛：前鞭毛（tinsel flagellum）表面附有三列管状茸毛（tubular mastigonemes / tripartite hairs），后鞭毛（whiplash flagellum）光滑，两者在运动学上协同产生推力。
形态特征与鞭毛结构
三列管状茸毛是不等鞭毛类的分子形态标志，由糖蛋白构成，在内质网中合成后转运至鞭毛表面。茸毛的存在使前鞭毛的推力方向逆转——水流从鞭毛尖端向基部运动，实现"拖拽式"游动。这种独特的运动方式在其他真核生物类群中未见。部分类群（如[[0. 硅藻纲（Diatomeae）]]）在营养体阶段失去鞭毛，仅在生殖细胞中保留。
主要类群与生态多样性
不等鞭毛总门包含约25个纲级类群，按营养方式可分为三大生态功能群：（1）光合自养类群，如[[0. 硅藻纲（Diatomeae）]]、[[0. 褐藻门（Phaeophyta）]]、金藻及黄藻，含有叶绿素a和c，质体来源于[[0. 红藻门]]的二次内共生；（2）吸收营养型类群，如卵菌（Oomycota），形态趋同于真菌但[[0. 细胞壁]]含纤维素而非几丁质，包括引起水霉病的水霉属；（3）吞噬营养型类群，如双鞭毛虫（bicosoecids）。
系统演化
分子系统学表明不等鞭毛总门是单系群，与囊泡虫类（Alveolata）和有孔虫界（Rhizaria）共同构成SAR超类群。其[[0. 叶绿体（Chloroplast）]]起源于一次红藻二次内共生事件。
参考资料
• Andersen RA. Biology and systematics of heterokont and haptophyte algae. *American Journal of Botany*, 2004.
• Cavalier-Smith T, Chao EE. Phylogeny and megasystematics of phagotrophic heterokonts. *Protist*, 2006.