疣微菌门（Verrucomicrobiota）是一类革兰氏阴性[[0. 细菌（Bacteria，细菌域）]]，以部分种类细胞表面具有疣状突起（verruca，拉丁语"疣"）而得名。形态多样，有球状、杆状和带有前列突起的梨形细胞。部分种类具细胞内隔室结构，与[[浮霉菌门（Planctomycetota）]]类似。
疣微菌门分布广泛，在淡水、海水、土壤及动物肠道中均有检出。在水生环境中，疣微菌常见于沉积物和有机颗粒表面，参与多糖类物质的分解。部分种类如嗜黏蛋白阿克曼氏菌（*Akkermansia muciniphila*）是哺乳动物肠道的重要共生菌。从系统演化看，疣微菌门与[[浮霉菌门（Planctomycetota）]]和[[衣原体门（Chlamydiota）]]共同构成PVC超门。在水族滤材生物膜中偶有检出，其生态功能仍在持续研究中。
参考资料
• Schlesner, H. et al. (2006). Phylum Verrucomicrobia.
• Hedlund, B. P. (2010). Phylum Verrucomicrobia in Bergey's Manual.