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学而记

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脱硫和硫化合物功能菌

如下菌属在功能特点上与上述类似 上述是定义在硫酸盐还原,而如下菌属则是在硫化合物 sulfur compounds 还原。虽然硫化物和硫化合物在中文或外文语境中有时有混用,但硫化物在化学中的一般意义是指无机硫化物,而且是二价硫离子无机化合物,而硫化合物则可包含有机含硫化合物和无机含硫化合物。 硫还原细菌 SRB 表 6 https://wswxtb.ijournals.cn/html/

如下菌属在功能特点上与上述类似[上述是定义在硫酸盐还原,而如下菌属则是在硫化合物(sulfur compounds)]还原。虽然硫化物和硫化合物在中文或外文语境中有时有混用,但硫化物在化学中的一般意义是指无机硫化物,而且是二价硫离子无机化合物,而硫化合物则可包含有机含硫化合物和无机含硫化合物。

硫还原细菌(SRB) ([表 6](https://wswxtb.ijournals.cn/html/wswxtbcn/2017/6/tb17061471.htm#Table6))与硫酸盐还原细菌(SRB) ([表 5](https://wswxtb.ijournals.cn/html/wswxtbcn/2017/6/tb17061471.htm#Table5))在英文简称中是一样的,无论在中外,都有一定的混淆,因为要精确地定义这些功能仍然复杂。严格地说,硫还原细菌只还原硫(S0),而硫酸盐还原细菌则是针对硫酸盐(SO42-),但两者在生成的产物——硫化氢方面是一致的。而有些菌属,如**弯曲杆菌属**(_Campylobacter_)、**假单胞菌属**(_Pseudomonas_)、**变形菌属**或**普罗狄斯菌属**(_Proteus_)和**沙门姓菌属**(_Salmonella_)等,除了能还原元素硫以外,也能利用氧气或其它末端电子受体。当然,硫还原细菌这种说法也已经不再精确,**脱硫果菌属**已经是古菌了([表 6](https://wswxtb.ijournals.cn/html/wswxtbcn/2017/6/tb17061471.htm#Table6)),硫还原菌或硫还原原核微生物(SRP)更加正确。

表6:硫还原菌列表

| 序号 <br>No. | 年 <br>Year | 域 <br>Domain | 中文菌属名 <br>Chinese genus | 拉丁文菌属名 <br>Latin genus | 种数/种 <br>Number/species | 功能 <br>Function | | ----------- | ----------- | ------------- | ------------------------ | ----------------------- | ------------------------ | ---------------- | | 1 | 1977 | | **脱硫单胞菌属****a** | Desulfuromonas | 7 | 硫还原 | | 2 | 1983 | 古 | **脱硫果菌属****b** | Desulfurococcus | 5 | 硫还原 | | 4 | 1994 | | **脱硫芭蕉菌属****d** | Desulfuromusa | 4 | 硫还原 | | 5 | 1998 | | **脱硫小杆菌属****a** | Desulfurobacterium | 3 | 硫还原 | | 3 | 1987 | 古 | 脱硫璆菌属c | Desulfuroglobus | 1 | 硫化物还原 | | 6 | 2008 | | **脱磂杆菌属****a** | Dethiobacter | 1 | 硫化合物还原 | 注: a:此属是对硫进行还原的,可能包含硫化物(硫酸盐); b:此属是对硫进行还原的,包含硫化合物(硫酸盐); c:此属是对硫化合物进行还原的,包含硫酸盐,此属1996年归属到1986年定的**酸亚纳斯菌属**(_Acidianus_),表明其它未以脱硫或脱硫化定名的菌属中,可能仍然包含这些功能特性的微生物; d:此属是对硫进行还原的,可能包含硫化物,值得一提的是,在2004年被归属到**脱硫化豆菌属**(_Desulfofaba_)的2001年定名的脱硫化芭蕉菌属(_Desulfomusa_),属名与1994年定的**脱硫芭蕉菌属**(_Desulfuromusa_)极为相似,容易产生混淆.

绿硫细菌(表 2)与硫还原细菌(表 6)可能存在协同共生关系,因为绿硫细菌氧化硫化氢产生硫(S0),而生成的硫则被硫还原细菌再次还原成硫化氢,复又成为绿硫细菌的电子供:。最早发现具有硫还原功能的可能是1977年的脱硫单胞菌属(Desulfuromonas),以及脱硫菌属(Desulfurella)、地杆菌属(Geobacter)和淖杆菌属(Pelobacter),这些菌属将有机底物完全氧化为二氧化碳。还包括硫小螺体属(Sulfurospirillum)、沃林姓菌属(Wolinella)、弯曲杆菌属(Campylobacter)和希万姓菌属(Shewanella),这些菌属不能把有机底物完全氧化为二氧化碳。

另外,还有用硫酸盐、亚硫酸盐、硫代硫酸盐、四连硫酸盐、硫胺、脱硫酸盐、脱硫化、脱磺化等菌属/种,反映了这些菌属/种的功能特征([表 7](https://wswxtb.ijournals.cn/html/wswxtbcn/2017/6/tb17061471.htm#Table7))。

表 7 List of other sulfur-function microorganisms

| 序号 <br>No. | 年 <br>Year | 中文菌属名 <br>Chinese genus | 拉丁文属名 <br>Latin genus | 数量/种 <br>Number/species | 功能 <br>Function | | ----------- | ----------- | ------------------------ | ---------------------- | ------------------------ | ---------------------- | | 1 | 1994 | 脱亚硫酸盐小杆菌属 | Desulfitobacterium | 6 | ^{2-}$还原 | | 9 | 2006 | 脱亚硫酸盐杆菌属 | Desulfitibacter | 1 | ^{2-}$还原 | | 14 | 2010 | 脱亚硫酸盐孢菌属 | Desulfitispora | 1 | ^{2-}$还原 | | 4 | 1997 | 脱磂代硫酸盐弧菌属 | Dethiosulfovibrio | 5 | ^{2-}$还原 | | 11 | 2007 | 脱磂代硫酸盐杆菌属 | Dethiosulfatibacter | 1 | ^{2-}$还原 | | 6 | 2004 | 脱硫酸盐竿菌属 | Desulfatibacillum | 2 | ^{2-}$还原 | | 7 | 2004 | 热脱硫酸盐菌属 | Thermodesulfatator | 2 | ^{2-}$还原 | | 10 | 2007 | 脱硫酸盐杖菌属 | Desulfatiferula | 2 | ^{2-}$还原 | | 12 | 2008 | 脱硫酸盐杵菌属 | Desulfatirhabdium | 1 | ^{2-}$还原 | | 15 | 2013 | 脱硫酸盐针菌属 | Desulfatitalea | 1 | ^{2-}$还原 | | 16 | 2014 | 脱硫酸盐橡菌属 | Desulfatiglans | 2 | ^{2-}$还原 | | 8 | 2005 | 四磂杆菌属 | Tetrathiobacter | 2 | 氧化四连硫酸盐(^{2-}$) | | 13 | 2008 | 热硫化物杆菌属 | Thermosulfidibacter | 1 | ^{2-}$的氧化 | | 2 | 1996 | 亚硫酸盐杆菌属 | Sulfitobacter | 1 | 分解亚硫酸盐 | | 3 | 1996 | **硫胺竿菌属****b** | Aneurinibacillus | 6 | 分解硫胺素 | | 5 | 1999 | **脱磺化孢菌属****d** | Desulfonispora | 1 | 去磺化,磺酸盐脱除 | 注: a:亚硫酸盐(sulfis-itis)或脱亚硫酸盐(de-); b:拉丁文中并未直接出现硫; d:脱磺化(desulfono-),表示去磺化(脱除磺酸盐)的,很少见;