本文通过简化，主要论述属名和种名中含有硫/磂的菌属，适当论及一些知名功能菌，共计170余属，600余种，基本包括了已经发表的种属，并分类论述了这些功能菌的硫和硫化物的还原、氧化和歧化等主要功能特色。
本文不涉及菌名中不含硫的菌(仅根据需要有选择性的包含了一部分)，今后对硫功能菌的综合探讨须拓展到所有属种(虽所余不多，但不能忽略菌名中不含硫/磂的)。比如古菌中至少有3个属，古璆菌属(Archaeoglobus)、热苗菌属(Thermocladium)和烫幡菌属(Caldivirga)，涉及到硫酸盐还原。1995年定的模式种烂臭全噬菌(Holophagafoetida)，菌名中无硫，但是其产生甲硫醇和二甲基硫醚等硫化合物。而互营杆菌属(Syntrophobacter)是一属非常特殊的硫酸盐还原菌。另一方面，即使以硫命名，也可能与硫功能菌无关，比如恐硫果菌属(表 4)，是害怕硫的微生物，也就是对硫的代谢无关。
硫功能菌作为一类非常特殊而又至关重要的微生物，在整个生态系统中扮演着极为重要的角色，值得进一步深入研究。