称谓
硫菌 sulfur microorganisms
分类依据
功能更复杂,**单独定名时多为硫氧化**(如[[硫叶菌属(Sulfolobus,Sul-folobus)]]、硫化竿菌属 _Sulfobacillus_);**与 “脱”(de-)复合时则表示硫还原**(如脱硫菌属 _Desulfurella_、脱硫小螺体属 _Desulfurispirillum_)。 此外,硫菌中还存在特殊类群,如恐硫果菌属( _Sulfophobococcus_ ),虽以 “硫” 定名,却不具备硫代谢功能,是硫菌中唯一不参与硫循环的类群。
按代谢归纳
• 硫氧化
• 硫还原
• 元素硫还原
• 硫酸盐还原
• 硫化合物还原
• 硫代谢
描述
共 23 属 56 种,包含[[0. 细菌(Bacteria,细菌域)]]和[[0. 古菌(Archaea,古菌域,古细菌)]](至少 4 属为古菌域,表 4)。相比[[磂菌]],其分类范围更广泛,涵盖了更多跨域的微生物类群。 例如:
• 古菌域的[[硫叶菌属(Sulfolobus,Sul-folobus)]]、硫果菌属( _Sulfurococcus_ );
• 细菌域的硫化竿菌属( _Sulfobacillus_ )、硫小螺体属( _Sulfurospirillum_ )等。
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表 4 硫菌列表Table 4 List of sulfur microorganisms
| 序号 <br>No. | 年 <br>Year | 域a <br>Domaina | 中文菌属名 <br>Chinese genus | 拉丁文菌属名 <br>Latin genus | 种数/种 <br>Number/species | 功能 <br>Function | | ----------- | ----------- | --------------- | ------------------------ | --------------------------------- | ------------------------ | ---------------- | | 1 | 1972 | 古 | **硫叶菌属****b** | [[硫叶菌属(Sulfolobus,Sul-folobus)]] | 8 | 硫氧化 | | 2 | 1991 | 细 | **硫化竿菌属****c** | Sulfobacillus | 6 | 硫氧化 | | 3 | 1993 | 细 | **脱硫菌属** | Desulfurella | 4 | 硫还原 | | 4 | 1993 | 细 | **硫小螺体属** | Sulfurospirillum | 8 | 元素硫还原 | | 5 | 1995 | 细 | **脱硫葡菌属** | Desulfacinum | 2 | 硫酸盐还原 | | 6 | 1995 | 古 | **硫果菌属****d** | Sulfurococcus | 2 | 硫氧化 | | 7 | 1997 | 古 | **恐硫果菌属****e** | Sulfophobococcus | 1 | 无 | | 8 | 1998 | 古 | **硫球菌属****f** | Sulfurisphaera | 1 | 硫代谢 | | 9 | 2003 | 细 | **硫氢菌属** | Sulfurihydrogenibium | 5 | 硫同化 | | 10 | 2003 | 细 | **硫单胞菌属****g** | Sulfurimonas | 4 | 硫氧化 | | 11 | 2004 | 细 | **硫曲菌属** | Sulfuricurvum | 1 | 硫同化 | | 12 | 2004 | 细 | **硫卵菌属****h** | Sulfurovum | 2 | 硫氧化 | | 13 | 2006 | 细 | **硫幡菌属** | Sulfurivirga | 1 | 硫氧化 | | 14 | 2007 | 细 | **脱硫孢菌属** | Desulfurispora | 1 | 硫化合物还原 | | 15 | 2008 | 细 | **脱硫弧菌属** | Desulfurivibrio | 1 | 硫化合物还原 | | 16 | 2010 | 细 | **脱硫螺体属** | Desulfurispira | 1 | 硫还原 | | 17 | 2010 | 细 | **脱硫小螺体属** | Desulfurispirillum | 2 | 元素硫还原 | | 18 | 2014 | 细 | **脱硫竿菌属** | Desulfuribacillus | 1 | 硫还原 | | 22 | 2014 | 细 | **脱硫竿菌属** | Desulfuribacillus | 1 | 硫还原 | | 19 | 2010 | 细 | **硫胞菌属** | Sulfuricella | 1 | 硫氧化 | | 20 | 2011 | 细 | **硫针菌属** | Sulfuritalea | 1 | 硫氧化 | | 21 | 2012 | 细 | **热硫单胞菌属** | Thermosulfurimonas | 1 | 硫氧化 | | 23 | 2014 | 细 | **硫体属** | Sulfurisoma | 1 | 硫氧化 | | | | | | | | |
注: a:域是生物分类学中最高的级别,“古”表示[[0. 古菌(Archaea,古菌域,古细菌)]],“细”表示[[0. 细菌(Bacteria,细菌域)]]; b:此属是硫的氧化生物; c:此属是硫的氧化生物,区别于1904**磂竿菌属**(_Thiobacillus_); d:区别于1998年的**磂果菌属**(_Thiococcus_); e:对硫恐惧的菌属,此属可能是以硫定名中惟一不具备硫功能的菌属; f:区别于1984年的**磂球菌属**(_Thiosphaera_); g:区别于1997年的**磂单胞菌属**(_Thiomonas_) 8种; h:区别于1913年的**磂小卵菌属**(_Thiovulum_),此属已定1种.
种名中用的较少,模式种目前仅两种:1993年新合并的模式种**热硫生热厌氧小杆菌**(_Thermoanaerobacterium thermosulfurigenes_)和2005年定的模式种**嗜硫石单胞菌**(_Petrimonas sulfuriphila_)。