全程硝化菌 (Complete ammonia oxidizer)
长期以来，人们尚未发现一种硝化细菌能够直接把氨转变成硝酸盐，直到近年来发现的一些全程硝化菌（Comammox Bacteria，CB）。起初人们认为它们会存在于自然界中一些不常见的地方，然而近年来发现，全程硝化菌在自然环境(如水体，土壤，空气)和人工系统(如污水处理厂，饮用水处理系统，循环水产养殖系统等)中广泛存在。
2015年圣诞节，Nature发表两篇文章，报道了有氨氧化活性的硝化螺菌属的微生 物。这打破了一百多年来一直认为的硝化过程是由氨氧化微生物和硝酸化微生物合 作完成的认识。
基因组分析结果表明，全程硝化菌除了利用氨、尿素以及亚硝酸盐作为能源物质之外，也可能把氢气、甲酸等作为能源物质。因此，全程硝化菌可能与其它物质循环 也有关联。
对于生物体来说，从氨到硝酸盐的完全硝化作用（comammox），而不是只进行两个步骤中的其中一个，在能量上是有利的。
代表物种
| 种 | 栖息地 | 特性 | | --------------------------------- | --------------------- | --- | | [[硝螺旋菌意外种（Nitrospira inopinata）]] | 热水中的菌席(56 °C, pH 7.5) | 棒状 |