定义
琥珀(Amber)是三种[[0. 终止密码子]]之一,序列为UAG。UAG指示[[0. 核糖体]]终止多肽合成,是最早被发现和命名的无义密码子。
命名由来
1962年,Harris、Bernstein等人在T4噬菌体中发现一类条件致死突变——突变型在某些大肠杆菌宿主中无法生长,但在携带抑制tRNA的菌株中可恢复生长。研究者Bernstein的母亲姓氏含"琥珀"之意(德语Bernstein即琥珀),遂以此命名。这一发现直接证实了[[mRNA密码子(Codon)]]的无义终止功能。
识别机制
当UAG暴露于[[0. 核糖体]]A位点时,释放因子RF1特异性识别UAG。RF1通过其PxT基序(Pro-x-Thr)识别密码子第二位A,通过SPF基序识别第一位U。RF1进入A位点后,触发[[0. 50S大亚基]]催化水解肽键与P位点[[转运RNA(tRNA)]]之间的酯键,释放新生多肽。
RF1同时识别UAG与UAA(赭石),而RF2识别UGA([[蛋白石(Opal)]])与UAA,三种[[0. 终止密码子]]由此被两个释放因子覆盖。
抑制突变
琥珀抑制tRNA携带突变的[[tRNA反密码子(Anticodon)]](CUA),可识别UAG并插入氨基酸,使翻译通读终止位点。这一机制在分子生物学中被广泛用于非天然氨基酸的定点插入技术。
参考资料
• Brenner S, Stretton AOW, Kaplan S. Genetic code: the 'nonsense' triplets for chain termination and their suppression. *Nature*. 1965;206:994-998.
• Eggertsson G, Söll D. Transfer ribonucleic acid-mediated suppression of termination codons in *Escherichia coli*. *Microbiol Rev*. 1988;52(3):354-374.