四氢甲烷蝶呤（H4MPT）途径

另一条主要的异化途径为四氢甲烷蝶呤（H4MPT）途径，与古细菌中的产甲烷菌里发现的$还原途径相似。 这条途径包含一个古细菌特异性辅因子-四氢化亚甲基蝶呤（H4MPT），同时酶的编码基因与特异性古细菌的相似。因此，推测此基因可能从古细菌中横向转移过来。在此类代谢途径中，有两种类似的酶参与了氧化亚甲基H4MPT形成甲川H4MPT，

一种为：NAD依赖性酶：H4MPT途径的特异性酶， 另一种为NADP依赖型酶：能参与H4MPT和H4F两种途径。

此途径中最后的氧化过程仍然未知。