概述
天冬氨酸转氨甲酰酶(aspartate transcarbamoylase, ATCase)是[[嘧啶]]核苷酸从头合成的关键限速酶,催化氨甲酰磷酸与天冬氨酸缩合生成N-氨甲酰天冬氨酸(即乳清酸合成的第一步)。ATCase是别构调控的教科书级范例,其**结构**与功能的关系被邹承鲁等学者深入阐明。
酶学结构特征
大肠杆菌ATCase(c₆r₆)由6个催化亚基(C亚基,组成2个催化三聚体)和6个调节亚基(R亚基,组成3个调节二聚体)组成,总分子量约310 kDa。催化亚基负责底物结合和催化,调节亚基负责感知效应物。两类亚基通过锌原子(Zn²⁺)连接。
催化反应
$催化反应:$
[[氨甲酰磷酸]]+[[C4:天冬氨酸(Asp,aspartate)]]-->[[N-氨甲酰天冬氨酸(N-carbamoyl aspartate,C-Asp)]]+{i}$
\usepackage{chemfig}
\definecolor{cpk_P}{rgb}{1.00, 0.50, 0.00} % P
\begin{document}
\chemfig{
C
(=[2,]O
-[2,0.5,,,,transparent] %上边界支撑
)
(-[4,]H_2N)
(-[,]
% P
-[0,0.2,,,,transparent]{\chemmove{\draw[ultra thick,green,fill=cpk_P,line width=2pt] (0.1,0.12)circle(6pt);}P})
}
+
\chemfig{
C
(-[4,1]H_3N^{+})
(-[2,1]COO^{-})
(-[0,1]H)
-[6,1]\textcolor{red}{C}(-[7.9,0.35,,,,transparent]\textcolor{red}{H_{2}})
-[6,1,,,red]\textcolor{red}{C}(-[0.05,0.5,,,,transparent]\textcolor{red}{OO^{-}})
}
\begin{tikzpicture}
\draw [->] (0,0) to node[above] {ATCase} (1.4,0);
\end{tikzpicture}
\chemfig{
C
(-[4,1]H_2N^{+}-[4,1]C
(=[5]O)
(-[3]H_{3}N^{+})
)
(-[2,1]COO^{-})
(-[0,1]H)
-[6,1]\textcolor{red}{C}(-[7.9,0.35,,,,transparent]\textcolor{red}{H_{2}})
-[6,1,,,red]\textcolor{red}{C}(-[0.05,0.5,,,,transparent]\textcolor{red}{OO^{-}})
}
+{i}$
\end{document}催化过程中,氨甲酰磷酸先结合(有序机制),诱导活性位点闭合,再结合天冬氨酸进行亲核攻击,释放磷酸。
别构调控
ATCase的调控堪称精妙:
• **CTP反馈抑制**:[[嘧啶]]终产物CTP结合于R亚基,稳定T态(紧张态),降低酶对天冬氨酸的亲和力
• **[[ATP:三磷酸腺苷]]前馈激活**:ATP结合于R亚基的另一位点,稳定R态(松弛态),提高酶活性——体现了嘌呤/嘧啶核苷酸池的平衡调节
• **协同效应**:天冬氨酸的结合呈S形曲线,表现出显著的正协同性
参考资料
• ATCase的T→R态转变涉及催化三聚体的相对旋转(约12°)和轴向分离(约1.1 nm),是别构效应的结构基础
• ATCase是变构酶研究史上最重要的模型蛋白之一